Le Centre de linguistique appliquée (CLA) a été créé en 1958. Il est l'un des tout premiers centres à avoir développé un enseignement pratique des langues étrangères qui s’appuie sur les recherches en linguistique appliquée à l’enseignement, des outils et des méthodes modernes : laboratoires, méthodes communicatives, auto-apprentissage. Cette méthodologie a ensuite permis un enseignement sur des objectifs spécifiques et professionnels.

Aujourd’hui, le CLA, composante de l'Université de Franche-Comté, reçoit chaque année près de 4 000 inscriptions en provenance de tous les horizons.

Le CLA assure les missions suivantes :

• Enseignement du français langue étrangère (FLE) et d’une dizaine de langues étrangères (anglais, allemand, portugais, espagnol, italien, coréen, chinois, japonais, arabe, russe).
• Formation de professeurs et de formateurs de français
• Recherche universitaire et recherche & développement
• Expertise et missions à l’étranger, à la demande de nombreuses institutions éducatives et culturelles, des ambassades et de ministères français et étrangers - notamment le ministère de l'Europe et des Affaires Etrangères et le ministère de l'Education nationale.